El mejor formato de video MKV VS AVI

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  MKV

Es un formato de contenedor de multimedia con un estándar abierto y libre que puede contener cualquier número de flujos de datos en un solo archivo, como por ejemplo, una película puede estar codificada en MKV para contener las pistas de audio en dos idiomas distintos en un mismo archivo. El audio requerido se puede seleccionar cunado se reproduce. Conceptualmente este formato es muy similar a MP4 o AVI y comparten una arquitectura bastante parecida. Por esta misma razón es más fácil editar y almacenar archivos multimedia en formato MKV, además este permite almacenar una mayor cantidad de datos en un mismo archivo.

AVI

Por sus siglas en inglés (Audio Video Interleav), es un formato de contenedor de multimedia desarrollado por Microsoft para el entorno del sistema operativo Windows. AVI se desarrolló a partir del intercambio de recursos del formato de archivo RIFF, el cual era propiedad de IBM y Microsoft. El formato AVI comprime los datos tanto de audio como de video, por lo tanto su calidad dependerá bastante de la compresión.

Diferencias claves entre MKV y AVI:

1. MKV es un formato de contenedor abierto, mientras que AVI es un formato de contenedor cerrado cuyo propietario es Microsoft.
2. Ambos pueden usar los codecs más utilizados, como H.264 y A3C, pero AVI tiene limitaciones para H.264/AVC. Por lo tanto, el contenido HD puede no estar disponible.
3. AVI sólo puede almacenar un único flujo de vídeo y un único flujo de audio mientras MKV puede almacenar varios flujos de audio y vídeo en el mismo archivo (contenedor).

¿Cual Es Mejor?

La verdad es que en este punto solo te queda decidir a ti, a mi en lo personal me gusta mucho el formato MKV, pero en realidad tambien uso el AVI. 

En cuanto a mi respecta, todo depende de para que los quieras usar